SỞ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ THÀNH PHỐ CẦN THƠ

Khoa học, công nghệ và Đổi mới sáng tạo - Khơi dậy khát vọng kiến tạo tương lai

Đánh giá đa dạng di truyền và cấu trúc quần thể nguồn gen xoài (manifera spp.) bằng chí thị GBS – SNP

[29/04/2024 10:47]

Xoài (Manggifera indica L.) là cây ăn quả có giá trị kinh tế cao và được trồng phổ biến ở các vùng nhiệt đới và cận nhiệt đới trên thế giới. Không chỉ được sử dụng làm thực phẩm, các bộ phận của cây xoài như: Rễ, thân, lá, vỏ quả, hạt... còn được. sử dụng làm vị thuốc trong y học cổ truyền.

Việt Nam là quốc gia sản xuất xoài đứng thứ 13 thế giới về quy mô với diện tích canh tác hơn 114 nghìn ha, tổng sản lượng hơn 940 nghìn tấn. Đây đồng thời là mặt hàng trái cây xuất khẩu thế mạnh của nước ta trong những năm vừa qua. Trong quá trình sinh trưởng và phát triển, cây xoài chịu ảnh hưởng của nhiều yếu tổ sinh học (bệnh héo nhanh, bệnh loét cây, ruồi đục quả...) cũng như yếu tố phi sinh (nhiệt độ cực đoan, mưa bất thường, nhiễm mặn...). Thêm vào đó biến đổi khí hậu, mối đe dọa chính cho sản xuất nông nghiệp, cũng gây ra nhiều tác động tiêu cực ảnh hưởng trực tiếp đến năng suất và chất lượng quả xoài.

Hình minh họa (internet)

Mục tiêu của nghiên cứu này nhằm đánh giá mức độ đa dạng di truyền của 14 mẫu giống xoài có nguồn gốc từ các tỉnh, thành trong cả nước bằng chỉ thị đa hình đơn nuclcotide (SNP). Kỹ thuật GBS (Genotyping by sequencing) được ứng dụng để phát hiện và sảng lọc 1.860 chỉ thị SNP chất lượng cao và sử dụng trong phân tích cấu trúc quần thể (bằng phản mềm STRUCTURE), phân nhóm di truyền (bằng công cụ PowerMarker) cũng như các chỉ số đi truyền của các mẫu giống xoài. Kết quả cho thấy, bộ mẫu giống nghiên cứu có mức độ đa dạng di truyền tương đối cao, dựa trên chỉ số đa dạng gen. GD (0.259) và hệ số thông tin đa hình PIC (0,227) của các chỉ thị SNP. Bên cạnh phân nhóm của mẫu giống đối chứng nhóm ngoại Thanh Trà khác loài, 2 phân nhóm mẫu giống xoài đã được xác định - một phân nhóm bao gồm các mẫu giống xoài phía Nam có nền di truyền đồng nhất và một phân nhóm của các mẫu giống xoài còn lại có nền di truyền pha trộn. Kết quả phản ánh lịch sử lại giống, chọn tạo khép kín giữa các mẫu giống xoài phía Nam đã góp phản xây dựng cơ sở di truyền cho các nghiên cứu lưu giữ và khai thác nguồn gen xoài tại Việt Nam.

Tạp chí nông nghiệp và phát triển nông thôn, kỳ 1+2 tháng 2/2024
Bản quyền @ 2017 thuộc về Sở Khoa học và Công nghệ thành phố Cần Thơ
Địa chỉ: Số 02, Lý Thường kiệt, phường Tân An, quận Ninh Kiều, thành phố Cần Thơ
Điện thoại: 0292.3820674, Fax: 0292.3821471; Email: sokhcn@cantho.gov.vn
Trưởng Ban biên tập: Ông Trần Đông Phương An - Phó Giám đốc Sở Khoa học và Công nghệ thành phố Cần Thơ