Nhóm nghiên cứu đã tiến hành khảo sát, đánh giá chất lượng nước ao nuôi dựa vào các chỉ tiêu chủ yếu: các chất ô nhiễm hữu cơ (BOD5 và COD), nồng độ các chất dinh dưỡng (Tổng N và Tổng P), tại các khu vực quận Thốt Nốt, Ô Môn và huyện Cờ Đỏ đối với mô hình nuôi cá tra; quận Bình Thủy và huyện Phong Điền đối với mô hình nuôi cá trê lai.

Kết quả phân tích chất lượng nước tại các mô hình nuôi cho thấy, nguyên nhân dẫn đến chất lượng nước bị ô nhiễm là do dư lượng thức ăn gây ra. Đây vừa là tác nhân gây ô nhiễm môi trường ao nuôi, vừa ảnh hưởng đến hiệu quả kinh tế cho người nuôi. Tuy nhiên, đề tài chỉ mới bước đầu tính toán hệ số ô nhiễm cho từng ao nuôi cá dựa trên số liệu thu thập về môi trường nước, chưa xem xét đến ảnh hưởng đến bùn đáy.

Nhóm tác giả đề xuất, cần nghiên cứu về giống, phương thức sản xuất thân thiện môi trường, sản xuất thức ăn thủy sản, ứng dụng công nghệ mới trong nuôi thâm canh và bán thâm canh nhằm nâng cao năng suất, hạ giá thành nhưng vẫn đảm bảo mục tiêu bảo vệ môi trường trong thời gian tới.