Thông qua các dự án, Chương trình 68 đã triển khai được hầu hết các nội dung được phê duyệt, đặc biệt là nội dung tuyên truyền về sở hữu trí tuệ; tạo lập, quản lý và phát triển tài sản trí tuệ cho các đặc sản của địa phương.
Bước đầu, Chương trình 68 đã tạo ra một hướng đi mới cho các địa phương, các cơ quan chuyên môn trong việc triển khai các hoạt động hỗ trợ cộng đồng, doanh nghiệp tạo lập, quản lý và phát triển tài sản trí tuệ.

Chương trình đã có tác dụng rất lớn trong việc nâng cao nhận thức của xã hội về sở hữu trí tuệ. Một số nội dung đã thực hiện tương đối tốt, mang lại hiệu quả rõ rệt như hỗ trợ xác lập quyền đối với chỉ dẫn địa lý, nhãn hiệu tập thể, nhãn hiệu chứng nhận, đặc biệt là đối với các đặc sản địa phương trong lĩnh vực nông nghiệp.
Tuy nhiên, Chương trình còn một số hạn chế như: chưa phát huy được hết tiềm năng trong việc hỗ trợ phát triển tài sản trí tuệ; kinh phí được sử dụng từ Chương trình trong 5 năm qua còn ít so với các chương trình khác cũng như so với tầm quan trọng và ý nghĩa của Chương trình; ngoài lĩnh vực nông nghiệp, các ngành khác chưa tham gia nhiều vào Chương trình; một số nội dung quan trọng nhưng chưa triển khai được như mong muốn như hỗ trợ áp dụng sáng chế, hỗ trợ đăng ký sáng chế, hỗ trợ công tác bảo đảm thực thi quyền sở hữu trí tuệ, định giá tài sản trí tuệ, công tác hỗ trợ liên quan đến bản quyền, hỗ trợ phát triển tài sản trí tuệ ở các trường đại học, viện nghiên cứu…;
Nguyên nhân chủ yếu xuất phát từ việc các nội dung, dự án đều mới, lần đầu tiên được triển khai lại thuộc lĩnh vực rất đặc thù là sở hữu trí tuệ, một số nội dung triển khai rất khó ngay cả đối với cơ quan chuyên môn về sở hữu trí tuệ (định giá tài sản trí tuệ, xây dựng mô hình chuyển giao tài sản trí tuệ ...).
Vì vậy, Chương trình giai đoạn 2011-2015 sẽ khai đầy đủ, cân đối các nội dung của Chương trình; tiếp tục thúc đẩy các hoạt động tuyên truyền về sở hữu trí tuệ; nhân rộng các dự án đạt hiệu quả cao ở giai đoạn 2005-2010; tập trung triển khai các nội dung chưa triển khai được như mong muốn, đặc biệt là một số nội dung mới như hỗ trợ áp dụng các sáng chế của nước ngoài không được bảo hộ tại Việt Nam phục vụ hoạt động nghiên cứu, triển khai, sản xuất, kinh doanh và hỗ trợ áp dụng kết quả nghiên cứu khoa học nhằm nâng cao giá trị của các sản phẩm đã được bảo hộ sở hữu trí tuệ.