Hướng tới một loại thuốc điều trị tất cả các vi rút corona
Vắc xin an toàn và hiệu quả mang lại hy vọng chấm dứt đại dịch COVID-19. Tuy nhiên, sự xuất hiện có thể có các biến thể SARS-CoV-2 kháng vắc-xin, cũng như các vi rút corona mới, khiến việc tìm kiếm các phương pháp điều trị chống lại tất cả các vi rút corona trở nên quan trọng hơn bao giờ hết.
Hiện nay, các nhà nghiên cứu báo cáo trên Tạp chí Nghiên cứu Proteome của ACS đã phân tích các protein virus trên 27 loài vi rút corona và hàng nghìn mẫu từ bệnh nhân COVID-19, xác định các trình tự được bảo tồn cao có thể tạo ra các mục tiêu thuốc tốt nhất.
Thuốc thường liên kết bên trong “túi” trên các protein giữ thuốc vừa khít, khiến thuốc cản trở chức năng của protein. Các nhà khoa học có thể xác định các túi liên kết thuốc tiềm năng từ các cấu trúc 3D của vi rút có chứa protein. Tuy nhiên, theo thời gian, vi rút có thể biến đổi túi protein của chúng khiến thuốc không còn phù hợp.
Nhưng một số túi liên kết thuốc rất cần thiết đối với chức năng của protein đến mức chúng không thể bị đột biến và các trình tự này thường được bảo tồn theo thời gian ở các vi rút giống nhau và có liên quan. Các nhà khoa học muốn tìm các túi liên kết thuốc được bảo tồn cao nhất trong các vi rút chứa sprotein từ các mẫu bệnh nhân COVID-19 và từ các vi rút corona khác, tiết lộ các mục tiêu hứa hẹn nhất cho các loại thuốc pan-coronavirus.
Nhóm nghiên cứu đã sử dụng một thuật toán máy tính để xác định các túi liên kết thuốc trong cấu trúc 3D của 15 protein SARS-CoV-2. Sau đó, các nhà nghiên cứu đã tìm thấy các protein tương ứng trong 27 loài vi rút corona và so sánh trình tự của chúng trong các túi liên kết thuốc. Hai vị trí có thể bảo tồn dược chất được bảo tồn nhiều nhất là một túi chồng lên vị trí liên kết RNA của helicase nsp13 và một túi liên kết chứa vị trí xúc tác của RNA polymerase phụ thuộc RNA nsp12.
Cả hai loại protein này đều tham gia vào quá trình sao chép và phiên mã RNA của vi rút. Túi liên kết thuốc trên nsp13 cũng được bảo tồn cao nhất trong hàng nghìn mẫu SARS-CoV-2 được lấy từ bệnh nhân COVID-19, không có một đột biến nào. Các nhà nghiên cứu cho rằng các loại thuốc kháng vi-rút mới nhắm vào vị trí xúc tác của nsp12 hiện đang trong các thử nghiệm lâm sàng giai đoạn II và III đối với COVID-19, và vị trí liên kết RNA của nsp13 là một mục tiêu chưa được khám phá trước đây nên được ưu tiên cao để phát triển thuốc.
ctngoc