Hội nghị được tổ chức với mục đích báo cáo kết quả điều tra, nghiên cứu KH&CN ở nước ta thời gian qua, từ hội nghị KH&CN biển lần thứ IV (năm 1998) đến nay. Đồng thời thảo luận đề xuất phương hướng, nhiệm vụ nghiên cứu từ nay đến năm 2015 và 2020.

Theo đó, hội nghị sẽ tập trung thảo luận các chủ đề chính như: Khí tượng, thủy văn và động lực học biển; Địa lý, địa chất và địa vật lý biển; Sinh học và nguồn lợi sinh vật biển; Sinh thái, Môi trường và quản lý biển; Năng lượng, kỹ thuật công trình, vận tải và công nghệ biển; Xây dựng tiềm lực khoa học công nghệ biển…

Ngoài ra hội nghị còn có trưng bày, triển lãm các thành tựu KH&CN biển trong những năm qua.