Lũ thượng nguồn sông MeKong là do mưa lớn vùng trung, hạ Lào, lượng dòng chảy ở khu vực thượng nguồn chỉ chiếm 10 - 20%. Lũ ở đầu nguồn sông Cửu Long thường lên chậm, cường suất trung bình 3-4cm/ngày. Đỉnh lũ tại Tân Châu chủ yếu xuất hiện trong thời gian từ 20/9 - 20/10; đỉnh lũ trên sông Hậu tại Châu Đốc xuất hiện muộn hơn, chủ yếu là trong tháng 10.

Thủy triều Biển Đông mang đặc tính bán nhật triều không đều, mỗi ngày xuất hiện 2 chân và 2 đỉnh không đều nhau, các đỉnh triều kế tiếp nhau chênh lệch 30 – 40 cm, các chân triều lại chênh lệch rất lớn đến 2m. Trong 1 năm, dao động mực nước triều cũng có tính chu kỳ: cao nhất vào các tháng 10, 11, 12, 01, thấp nhất vào các tháng 5, 6, 7. Như vậy, đỉnh lũ trên sông Cửu Long xuất hiện vào đúng thời kỳ cao ở Biển Đông.

Qua thời gian nghiên cứu cho thấy, mối tương tác lũ-triều khu vực đầu nguồn sông Cửu Long phụ thuộc nhiều yếu tố: lượng nước thượng nguồn, độ lớn của thủy triều, mực nước tại chỗ,… Tùy theo cấp mực nước mà mức độ ảnh hưởng của lũ thượng nguồn hay thủy triều có khác nhau; tùy theo mức độ lũ thượng nguồn cao hay thấp, thủy triều Biển Đông mạnh hay yếu mà tác động của nó đến dòng chảy tại Tân Châu hoặc Châu Đốc cũng khác nhau. Với những kết quả phân tích năm 2011 cho thấy những thay đổi so với trước đây, đặc biệt là cơ chế truyền triều trên sông Cửu Long, sự thay đổi này cũng cần được xem xét đánh giá trong thời gian tới.